Nature:肠道微生物代谢产物新功能,促进HDAC3酵素

2021-10-20 00:50:35 来源:
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类动物肠道和对其正因如此的常与菌种的协同进化导致了肠道-菌种关系的发展。表观突变去除使得类动物细胞能够拆分外界环境频率,作出贡献细胞对环境的适应性。但是之前以来常与的消化系统菌种是从的多种频率自营和多种环境频率是如何精密核糖体的还不甚确实。

消化系统视网膜位于菌种集合起来和肠道之间的图标,作出贡献这两项屏障的形成,在肥胖中后期和损害中后期对消化系统视网膜透过必要。维持消化系统视网膜分化过程之前有多种表观突变机制策划其之前,其之前HDACs的表达对于消化系统稳态非常这两项。消化系统菌种是从的短链胆固醇甘油海盐(Butyrate)在体外抑制作用HDAC活性,甘油海盐处理方式后的消化系统的组织视网膜之前HDAC活性下降。在制剂狐之前植入产甘油海盐的消化系统菌种可能会抑制作用消化系统视网膜之前HDAC的活性。这些结果都暗示消化系统菌种是从的甘油海盐抑制作用HDAC的活性。但是消化系统菌种与组肽干乙酰化蛋白活性之间的核糖体机制是怎样的还不得而知。

已对,美国辛辛那提儿童医院教育之前心Theresa Alenghat副所长在Nature杂志上发表文章 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut,辨认出消化系统菌种是从的脂类氨基海盐能够调节消化系统内组肽干乙酰化蛋白HDAC3的活性从而作出贡献消化系统视网膜的复建,道出了肠道对于消化系统菌种频率的组织起来的具体机制。

为了道出消化系统菌种衍生激素衍生物与表观突变频率之间的关系,所写们对野生型式以及消化系统视网膜HDAC3敲除小狐之前的HDAC活性进性扫描,辨认出野生型式大鼠小狐之前的HDAC3表达经常性并且有着稳定的蛋白活性,但是消化系统视网膜HDAC3敲除小狐则相反。所写们打算告诉他HDAC3确实可能会特异性调节消化系统菌种敏感的频率其可能会。所写们辨认出HDAC1与HDAC2在消化系统视网膜之前也有表达,但并不能补偿消化系统视网膜之前HDAC3表达的紊乱。而且在对制剂狐和消化系统视网膜HDAC3敲除小狐之前的消化系统视网膜除去HDAC消毒剂抑制作用剂处理方式后,辨认出在HDAC3敲除后其他大类的HDACs依然有着活性。这些结果暗示消化系统菌种作出贡献视网膜之前HDAC3在经常性消化系统稳态之前的蛋白活性。

为了解密消化系统菌种激活HDAC3的具体机制,所写们对制剂狐和经常性培养的小狐之前消化系统视网膜之前的核糖体谱透过判别。所写们辨认出在消化系统菌种不存在的视网膜之前与脂类氨基激素相关的基因被广泛其可能会表达。宋人的研究辨认出脂类三氨基(Inositol trisphosphate)可能会通过精进HDAC3与激活肽的相互作用来增高HDAC3的活性。所写们辨认出除此以外脂类三氨基的确可能会特异性增高HDAC3-NcoR重组肽的活性,NcoR肽对于HDAC3的干乙酰化蛋白活性非常这两项。

全面性地,所写们打算告诉他制剂狐与大鼠的小狐消化系统之间脂类三氨基水准确实不存在差异。所写们辨认出大鼠小狐之前无论是肠腔还是消化系统视网膜之前脂类三氨基的水准都实着极低制剂狐,暗示消化系统菌种的不存在作出贡献脂类三氨基水准的增高。为了评估脂类三氨基对于消化系统视网膜之前HDAC3活性的负面影响,所写们对消化系统视网膜之前的HDAC3肽透过纯化并与脂类三氨基透过协同孵育,辨认出脂类三氨基的确能够增高内源HDAC3的活性。而且甘油酯造成的HDAC3活性的抑制作用也可以被脂类三氨基所拮抗。另外,所写们还辨认出常与的消化系统菌种可能会通过脂类六氨基(Phytate)激素唯一可作出贡献消化系统视网膜之前的HDAC3的功能。与脂类三氨基相似,脂类六氨基也可能会其可能会消化系统视网膜之前的HDAC3的活性。

为了扫描消化系统菌种脂类六氨基依赖的激素对于HDAC活性的负面影响,所写们对定植野生型式以及脂类六氨基蛋白紊乱型式菌株的小狐透过分析。所写们辨认出定植脂类六氨基蛋白经常性表达菌株的小狐相较于制剂狐以及脂类六氨基紊乱型式菌株小狐的脂类三氨基水准升高。对小狐透过右旋糖酐酯钠(Dextran sodium sulfate, DSS)处理方式后,可能会其可能会小狐产生消化系统癌症。为了扫描脂类三氨基在DSS处理方式其可能会的消化系统癌症之前的作用,所写们对制剂狐除去脂类三氨基后辨认出脂类三氨基能够作出贡献消化系统从癌症之前恢复并增高制剂狐的寿命。DSS其可能会的脑膜炎近似于病人之前溃疡性脑膜炎。为了全面性确认消化系统菌种激素衍生物的功能,所写们对人类拆分菌种组学计划(Integrative Human Microbiome Project)之前的肥胖样本以及溃疡性脑膜炎患者的样品透过扫描,辨认出在溃疡性脑膜炎病人消化系统之前脂类六氨基蛋白的总质量少低于肥胖样本之之前,暗示脂类六氨基对于消化系统损害复建是必须的。

总的来说,Alenghat副所长的工作辨认出相较于制剂狐,消化系统菌种不存在的小狐之前HDAC3活性实着减少,这一减少是通过常与的消化系统菌种比如菌株脂类六氨基以及脂类三氨基的激素形成的。另外,脂类三氨基可能会其可能会病人是从的消化系统类器官的生长、刺激HDAC3依赖的人体内以及拮抗甘油酯造成了的消化系统生长抑制作用,可能会作出贡献消化系统癌症之前视网膜的复建。因此,所写们认定辨认出了HDAC3作为肠道的组织起来多种消化系统菌种频率的相辅相成表观突变因子的重要功能,道出了消化系统菌种、表观突变因子以及菌种激素衍生物在消化系统视网膜以及消化系统癌症之前的重要核糖体和复建作用。

更早出处:

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.

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