Lancet Oncol:肾透明细胞癌与高血压悖论相关的转录组特征分析

2021-10-20 00:50:46 来源:
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一.分析背景

高血压与肾乳白色肝细胞乳癌 (ccRCC)的确实会降低有关,但高血压又对立地与该的病病征改善有关,其潜在系统亦然不指明。附属所写对高血压病征状和也就是说体形病征状在原发和刺毛周胆固醇4组织里的甲状腺转化和致病转录4组关联性进行分析许多附属代数据分析。

本文简介了突变所列达引致的微环境的关联性有效地所列述高血压病征状的生存优势(高血压不确定性)。

二.许多附属代数据分析流程三.文章讲解1.COMPARZ所列头、TCGA-KIRC所列头、MSK致病化疗所列头许多附属代数据收集、矫正

在COMPARZ所列头的453名病征状里,有375名(83%)病征状具备可用的微阵列许多附属代数据,化疗在此之前BMI测量以及无令人满意和整体生存许多附属代数据进行许多附属代数据分析(所列1)。除119名(26%)超重病征状外,来自COMPARZ试验的最终所列头都有256名(68%)病征状(n=256)。

所列1.COMPARZ化疗所列头的人口数许多附属代数据分析方法和临床研究相似性

TCGA-KIRC所列头里的332举例病征状里,审核了经肾切除法术化疗的152举例(46%)晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病征状的临床研究和人口数许多附属代数据分析方法许多附属代数据(所列2)。在回避59名(39%)超重病征状后,最后赢得的所列头都有93名病征状(n=93)。

所列2.晚期乳白色肝细胞肾肝细胞乳癌TCGA-KIRC所列头的统计学和临床研究相似性

从62举例MSK附近胆固醇4组织所列头里进行甲状腺切除法术的非冠心病乳白色肝细胞RCC病征状里赢得了继发性和附近胆固醇仪器。在这个所列头里,从59名病征状的PNN(肾周附近)附近胆固醇,25名病征状的PNA(所处肾周)附近胆固醇以及55名病征状的4组织里取样。在回避超重病征状最后,最终所列头都有41名(69%)PNN结果显示病征状, PNA结果显示为17(68%),结果显示为37(67%)。从最初的203名直接旁观者的MSK致病化疗分析人一组里回避74名(36%)超重病征状后,总生存许多附属代数据分析的最终所列头都有129名(64%)直接旁观者(所列3)(n=129)。

所列3. 采用MSK致病化疗的化疗所列头的人口数许多附属代数据分析方法和临床研究相似性

2.高血压的肾乳白色肝细胞乳帕金森氏病征状有一点注意也就是说体形的肾乳白色肝细胞乳帕金森氏病征状总生存期更长

根据KM生存许多附属代数据分析,在三4组里都找到高血压病征状的总生存期更长。在TCGA-KIRC所列头里,经分期录入后,高血压病征状的整体存活期精于也就是说体形4组;在COMPARZ所列头里,经IMDC确实会评价录入后,长相病征状的整体存活期也精于也就是说体形4组。在MSK致病疗法所列头里,经IMDC确实会评价录入后,BMI与死亡率的无相当大关联性(如平面图1)。

平面图1.TCGA-KIRC所列头 (A)、COMPARZ 所列头(B)和MSK致病化疗所列头(C)的总生存期

3.COMPARZ所列头里高血压病征状具备很好的PFS

对CPMPARZ所列头KM许多附属代数据分析后,KM切线看不止,COMPARZ所列头里高血压病征状比也就是说体形病征状具备很好的PFS。

平面图S1.COMPARZ所列头里高血压病征状比也就是说体形病征状具备很好的PFS

4.应用于二线药剂化疗,高血压病征状仍具备很好的OS

KM切线看不止了在应用于二线嘧啶转移酶抑制剂(pazopanib或Sunitinib)的两个化疗4组里,高血压病征状的OS即使如此较也就是说体形病征状好。

平面图S2.COMPARZ所列头应用于二线药剂化疗4组的总生存期许多附属代数据分析

5.COMPARZ所列头里,高血压与也就是说体形的病征状转录4组突变相似性普遍存在相当大关联性

做完上述许多附属代数据分析,所写在三个所列头里确认高血压不确定性普遍存在最后,接下来在COMPARZ所列头里对高血压和也就是说体形病征状审核了转录4组学关联性。先是做了Hallmark突变集的GSEA许多附属代数据分析,相对高血压病征状与也就是说体形病征状之间的关联性:高血压病征状里看不止氧气、TGF-β、内膜-间充质彻底改变和甲状腺转化频率闭环相当大上调,提示血块愈合必需的激活(平面图A)。平面图B是对平面图A筛选的几个突变所列达闭环的Enrichment plots。

平面图S4.COMPARZ所列头里高血压病征状与也就是说体形病征状的ccRCC转录4组突变相似性普遍存在相当大关联性

6.COMPARZ所列头与TCGA-KIRC所列头 里高血压比也就是说体形病征状的甲状腺转化评价高

在GESA共通的相似性突变集甲状腺转化评价相对里,高血压病征状少于也就是说体形病征状(如平面图2)。

平面图2.COMPARZ所列头(A)与TCGA-KIRC所列头 (B)里高血压原发病征状与也就是说体形病征状的甲状腺转化的z score

7.也就是说体形与高血压病征状的淋巴肝细胞一组无相当大关联性

对也就是说体形(7举例)与高血压(16举例)病征状的原发的主要淋巴肝细胞生产量均采用流式肝细胞法术进行审核。平面图A看不止了高血压病征状与也就是说病征状之间的淋巴肝细胞一组的整体关联性。平面图B指明看不止了高血压和也就是说体形病征状T肝细胞一组的灌注水平。找到也就是说体形与高血压病征状的淋巴肝细胞一组无明显关联性,淋巴肝细胞灌注的相对与BMI或多或少。

平面图S9.用流式肝细胞法术许多附属代数据分析也就是说体形与高血压病征状的淋巴肝细胞一组无明显关联性

8.与也就是说体形病征状相对,高血压病征状刺毛周胆固醇4组织瘙痒降低,尤为是附近的刺毛周胆固醇

在MSK的非冠心病ccRCC病征状的在此之前瞻性所列头里,所写合并了20个最相当大的多样化的IPA规范闭环,这些闭环来自于高血压和也就是说体形病征状的PNN和PNA结果显示的相对(平面图A)。高血压和也就是说体形病征状的PNN和PNA结果显示之间的致病灌注(ssGSEA评价)相对(平面图B)。

平面图S5.与也就是说体形的病征状相对,高血压病征状的肾周胆固醇看不止不止瘙痒和氧气降低

综上,在COMPARZ试验所列头里,经过IMDC确实会评价优化后,找到有一点注意也就是说体形病征状,嘧啶转移酶抑制剂化疗提升了高血压病征状的生存率,同样是放弃sunitinib化疗的病征状。IMDC确实会评价模型包含的三等量间接反映宿主心理因素对乳帕金森氏病征全面性瘙痒作用(举例如肾病,里性粒肝细胞激增,和骨髓激增病征),这些心理因素确实也是致病化疗结果和BMI之间关联系统的理由。找到高血压病征状的甲状腺转化积分少于也就是说体形病征状,与之在此之前其他的分析结果所列明的,直接参与甲状腺转化,β-氧化必需等等突变的富集的附属象一致。因此,甲状腺转化的关联性可以部分所列述高血压病征状放弃嘧啶转移酶抑制剂化疗后的较佳病病征。

此分析为高血压不确定性共享了生物化学默许。在患有ccRCC的病征状掩蔽到高血压病征状有一点注意也就是说体形的病征状微环境的关联性:同样是高血压病征状的的甲状腺转化降低,但整体瘙痒无明显关联性。有一点注意的是高血压病征状的附近胆固醇看不止降低的瘙痒和氧气状况。乳白色肝细胞乳癌与刺毛周胆固醇4组织微环境的复杂相互作用确实具备临床研究意义,有一点再进一步分析。

许多附属代不止处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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